瞄准热带畜禽和水产动物疫病发生机制前沿热点科学问题和新型防控技术，开展热带畜禽和水产动物疫病特别是外来疫病的监测和诊断，热带畜禽和水产动物重要病原致病机制以及病原与宿主互作研究，热带畜禽和水产动物抗感染免疫及抗环境胁迫机制研究，基于新型疫苗和生物制剂的疫病免疫防控和生态防控技术研究；保障热区畜禽和水产动物养殖产业的持续、稳定、健康发展。